A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

Protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban, A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

Azonban a nukleinsav-szekvenálás, a reverz genetika és a posztgenom-elemzés utóbbi 3 évben bekövetkezett forradalmi előrelépés azonban lépésről-lépésre megváltoztatta a malária parazita Plasmodium spp. Biológiájának megértését és annak gazdaszervezettel és vektorral való kölcsönhatásait. A Plasmodium fajok törzseiből, a különböző etnikai hovatartozású releváns emberi populációkból és a szúnyogvektorokból származó, nagy mennyiségű genomszekvencia-adat rendelkezésre állásának köszönhetően a kutatók a malárás folyamat bármely biológiai alkotóelemét izolálva vagy interaktív környezetben, azaz fertőzést tekinthetik meg.

Különösen jelentős előrelépés történt a népességgenomika területén, a Plasmodium falciparum mint rendkívül releváns modell szolgált. Az ilyen tanulmányok kimutatták, hogy a genom evolúciója erős szelektív nyomás alatt kimutatható.

Его темой был Диаспар. Он рисовал им город таким, каким увидел его в последний. Он описывал город, дремлющий на груди пустыни, возводил его башни, подобно словленным радугам, сверкающие на фоне неба.

Ezek az adatok a reverz genetikával kombinálva lehetővé tették a P. Ezen felül a P. Ez az áttekintés összefoglalja a legutóbbi izgalmas felfedezéseket, amelyeket a genomtechnológiák lehetővé tettek a malária kutatásában, és kiemeli alkalmazásuk némelyikét az egészségügyben.

A megszerzett ismeretek elősegítik a gyógyszeres rezisztencia kialakulásának vagy terjedésének megfigyelési megközelítéseinek kidolgozását, valamint a maláriaellenes gyógyszerek és esetleg oltások fejlesztésének új céljainak meghatározását.

  • A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények
  • Обе они станут здоровее, когда еще раз оглянутся спокойным и пристальным взглядом на потерянное ими прошлое.
  • A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények
  • Élősködők parazitákbol

Háttér Malária, amelyet az egysejtű protozoák Plasmodium spp. Jelenleg öt Plasmodium fajt ismertek emberi maláriát okozóként, amelyek közül a leghalálosabb a P. A frontális malária elleni gyógyszerekkel szembeni rezisztencia továbbra is megjelenik és terjed, amelyet súlyosbít az alternatívák bevezetésének lassú előrehaladása. A megfelelő hatékonyságú vakcinák továbbra is remény, nem valószínűség.

A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

Ennek fényében a malária genomon alapuló kutatása új lehetőségeket kíván elérni a terápiás vagy profilaktikus fejlődésben, biológiai ismeretek alapján, mint például az új gyógyszercélok és az oltási jelöltek azonosítása. A Pf laboratóriumi törzs genomszekvenciájának befejezésének mérföldkőét egy évtizeddel ezelőtt sikerült elérni [2] 1. Azóta - a zuhanó költségeknek és a következő generációs szekvenálási NGS technológiák fejlődésének köszönhetően - a nemzetség összes fő kládját képviselő fajok széles spektrumának teljes genom szekvenálása WGS kíséri, bár a az összes ismert protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban fertőző Plasmodium fajt szekvenálni kell [3].

Az Dironet tabletták férgek számára és a WGS kombinációja azonban lehetővé tette innovatív nagyszabású genomi amely jobb mérgező vagy antitoxin nano kidolgozását, például a genomi járványtani célra [4].

Ez különösen igaz az egy nukleotidos polimorfizmusokra SNPés bár a genom variáció más szempontjai például az indel protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban a másolat számának variációja jelenleg elmaradhatnak, a Az adatbázis hiányosságai ismertek és határozottan a kutatók látványában vannak. Ez az ábra kiemeli az irányadó tanulmányokat, amelyek protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban betekintést nyújtanak a parazita felépítésébe, fejlődésébe és patogenezisébe sárga dobozokvalamint kritikus technikai fejlődésbe kék dobozokmivel az első Plasmodium genomot ben tették közzé [2, 5, 12, 13, 27, 29, 31, 39, 40, 42, 43, 48—50, 53, 54, 57, 66, Az ebben az áttekintésben kiemelendő előrelépések a következők: a parazita ART-rezisztencia molekuláris mechanizmusainak feltárása; az epigenetikus kódot író hisztonmódosító enzimek mint például a Pf-hiszton-dezacetiláz 2 PfHDA2 és az olvasófehérjék mint például a Pf heterochromatin protein 1 PfHP1 funkcionális azonosítása, amelyek másokkal például mint RNaseII jelentős szerepet játszanak az antigén variációk szabályozásában és a szexuális fejlődés iránti elkötelezettségben.

Ezenkívül a gazdaszervezet és a növekvő számú protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban egyre növekvő számát és mélységét jellemezték, lehetővé téve ezeknek a genomoknak a Plasmodium-fertőzéssel kombinált metaanalízisét.

Ezek a tanulmányok felfedték a malária parazitával szembeni rezisztenciához kapcsolódó fontos lókuszokat a gazdaszervezetben és a vektorban, [5, 6], és rámutattak a malária által stimulált genetikai fegyverzet versenyének genomi hotspotjaira.

Az afrikai genomváltozási projekt felismeri az etnikumok és a genotípusok jelentős változatosságát, és ezért a WGS, az imputáció és az SNP feltérképezése révén adatbázist kíván létrehozni, amelyen keresztül a betegségek előfordulása és kimenetele megbízhatóan összekapcsolható a haplotípusokkal [7]. Az ilyen szélesebb elemzések már megerősítették az SNP asszociációkat öt jól ismert tulajdonsággal, ideértve a hemoglobinopathiákat és a glükózfoszfát-dehidrogenáz G6PD hiányt, ám 22 másik dolgot megcáfoltak, amelyeket kisebb volumenű vizsgálatok összekapcsoltak [8].

A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

Ez a tanulmány a G6PD ellentétes hatásait is kimutatta a maláriafertőzés különféle halálos következményeire, felfedve a társulások eddig nem várt komplexitását. A folyamatban lévő elemzések új, bár nem meglepő példákat tártak fel a lókuszok haplotípusaival kapcsolatban, amelyek a súlyos malária elleni védelemhez kapcsolódnak, mint például a 4-es kromoszómán található glikophorin lókusz [8, 9]. Vektorgenomika Afrikában a malária elsősorban a nőstény Anopheles gambiae Ag szúnyogok által terjed. Az ag szúnyoggenomika malária terjedésében játszott szerepének megértésére szolgáló megközelítések hasonlóak voltak az afrikai genom variációs projekthez.

Emberi genomika

Az Anopheles vektor genom nagyon dinamikus. Az összehasonlító vektorgenomika gyors génnövekedést és veszteséget tárt fel a Drosophila-hoz képest, valamint a szignifikáns intragenikus sokféleséget és az inszekticidrezisztenciában és a malária elleni protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban részt vevő gének keveredését [10, 11].

Az ilyen sokféleség jellege és mértéke kizárja a klasszikus GWAS megközelítések alkalmazását, és a fenotípus-alapú, fenotípusvezérelt, összevont szekvenálás új megközelítését, valamint a gondosan kiválasztott alapító kolóniákban lévő kapcsolási térképezéssel párhuzamosan használják a vektor-fenotípusok feltérképezésére.

Ez a tanulmány nemrégiben fedezte fel a TOLL11 mint olyan gént, amely védi az afrikai szúnyogokat a Pf-fertőzés ellen [6].

A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények

Parazita genomika A humán fertőző paraziták számos Pf [2], Plasmodium vivax [12] és Plasmodium knowlesi [13] törzséhez teljes genomszekvencia áll rendelkezésre. A fő parazitákként gyakran használt főemlős és rágcsáló fertőző fajokat szintén szekvenáltuk, beleértve a Plasmodium berghei-t Pba Plasmodium cynomolgi-t, a Plasmodium chabaudi-ot és a Plasmodium yoelii-t [14].

Protein palmitoilezés és patogenezis apicomplexan parazitákban közelmúltban további hét főemlős fertőző faj genomjai váltak elérhetővé, bizonyítva a szoros kapcsolatot a Pf és a csimpánzfertőző fajok között [15].

A körülbelül ilyen génből álló, konzervált genom elfoglalja a központi kromoszomális régiókat, míg a multigéncsaládok amelyeknek legalább egy része antigén variációval társul nagyrészt a szubtelomer régiókban oszlanak meg. A nem kódoló RNS ncRNS géneket [16] és az antiszensz transzkripciót [17, 18] a Pf-ben katalogizálják, de valószínűleg ez a katalógus hiányos, mivel csak vérfázisú parazitákat vizsgáltak komolyan ebben a tekintetben, és az ncRNS-ek nagyrészt ismeretlen jelentőséggel bírnak.

A Pf egyik legfontosabb jellemzője, hogy az ember által előidézett szelekciós nyomás hatására gyógyszerek és potenciálisan oltások formájában alakuljon ki.

  1. A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények
  2. A malária genomikájában és az epigenomikában a közelmúltban elért eredmények
  3. Это не .
  4. Кем это запрещено.
  5. И хотя его внешний облик подавлял своей сложностью, он был лишь намеком на скрытые чудеса технологии, без которых все эти грандиозные здания были бы безжизненными могильниками.